Perbandingan morfometri dan sekuen gen CO1 pada tiga populasi udang galah Probolinggo, Si Jawa, dan Mahakam

Gunawan, Almaida Khansa (2024) Perbandingan morfometri dan sekuen gen CO1 pada tiga populasi udang galah Probolinggo, Si Jawa, dan Mahakam. S1 thesis, Universitas Ahmad Dahlan.

	Text (JUDUL) T1_2000017014_JUDUL__240624090033.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB) | Request a copy
	Text (BAB I) T1_2000017014_BAB_I__240622113759.pdf Restricted to Repository staff only Download (349kB) | Request a copy
	Text (BAB II) T1_2000017014_BAB_II__240622113759.pdf Restricted to Repository staff only Download (480kB) | Request a copy
	Text (BAB III) T1_2000017014_BAB_III__240622113759.pdf Restricted to Repository staff only Download (528kB) | Request a copy
	Text (BAB IV) T1_2000017014_BAB_IV__240622113759.pdf Restricted to Repository staff only Download (567kB) | Request a copy
	Text (BAB V) T1_2000017014_BAB_V__240622113759.pdf Restricted to Repository staff only Download (332kB) | Request a copy
	Text (Daftar Pustaka) T1_2000017014_DAFTAR_PUSTAKA__240622113759.pdf Restricted to Repository staff only Download (476kB) | Request a copy
	Text (Lampiran) T1_2000017014_LAMPIRAN__240622113759.pdf Restricted to Repository staff only Download (578kB) | Request a copy

Abstract

Udang Galah (Macrobrachium rosenbergii de Man 1879) adalah salah satu spesies udang air tawar terbesar di keluarga Palaemonid dan merupakan yang terbesar di antara semua jenis udang air tawar. Udang galah dibudidaya oleh Unit Kerja Budidaya Air Payau Balai Budidaya Udang Galah (UKBAP BBUG) Samas Kabupaten Bantul, Yogyakarta dan Instalasi Budidaya Air Payau (IBAP) Probolinggo, Jawa Timur. Budidaya udang galah di Yogyakarta oleh UKBAP BBUG mengalami inbreeding depression yang mengakibatkan penurunan heterozigositas, performa reproduksi, dan kualitas udang galah. Tujuan dari penelitian ini adalah membandingkan variasi morfometri dan variasi genetik pada tiga, yaitu populasi Probolinggo, populasi Si Jawa, dan populasi Mahakam menggunakan penanda gen CO1 dengan primer LCO1490 & HCO2198. Penelitian ini dimulai dengan pengambilan induk udang galah dan pengukuran enam karakteristik morfometri. Selanjutnya, dilakukan pengamatan variasi genetik menggunakan sampel otot bagian abdomen udang galah. Prosesnya meliputi ekstraksi DNA, uji elektroforesis kualitatif, uji spektrofotometri kuantitatif, amplifikasi gen CO1, uji elektroforesis DNA hasil amplifikasi, sekuensing gen CO1, dan analisis kekerabatan dengan pohon filogenetik. Analisis data morfometri menggunakan aplikasi SPSS 16 dan MVSP 3.22, sementara analisis variasi genetik mengacu pada hasil uji kualitatif dan kuantitatif. Hasil variasi morfometri udang galah dari tiga populasi menunjukkan populasi Probolinggo lebih unggul dibandingkan dua populasi lainnya. Populasi Probolinggo unggul pada rasio panjang total : panjang standar dan rasio panjang total : panjang abdomen, sementara nilai pada rasio lainnya menunjukkan hasil yang rendah. Hal ini menunjukkan dominansi ukuran tubuh yang panjang dengan fokus pada bagian abdomen. Udang galah populasi Si Jawa memiliki variasi genetik dekat dengan populasi Mahakam dan jauh dengan populasi Probolinggo. Jarak genetik antara populasi Probolinggo dengan populasi Si Jawa dan populasi Mahakam sebesar 0,002. Jarak genetik antara populasi Si Jawa dengan populasi Mahakam sebesar 0,00. Karakter morfometeri yang signifikan adalah rasio panjang total : panjang sefalotoraks, rasio panjang total : panjang rostrum, dan rasio panjang total : panjang abdomen dengan jarak genetik Si Jawa lebih dekat dengan populasi Mahakam dibandingkan dengan populasi Probolinggo.

Item Type:	Thesis (S1)
Keyword:	Inbreeding depression, heterozigositas, LCO1490, HCO2198
Subjects:	Q Science > Q Science (General) S Agriculture > SF Animal culture
Divisi / Prodi:	Faculty of Applied Science and Technology (Fakultas Sains Dan Teknologi Terapan) > S1-Biology (S1-Biologi)
Depositing User:	userperpus2 userperpus2
Date Deposited:	27 Jun 2024 07:27
Last Modified:	27 Jun 2024 07:27
URI:	http://eprints.uad.ac.id/id/eprint/64728

Actions (login required)

View Item