Prediksi aktivitas antibakteri senyawa dalam fraksi aktif ekstrak etanol daun kersen (Muntingia calabura L) pada enzim dihydropteroate synthetase streptococcus pneumoniae secar in silico

Regita, Regita (2024) Prediksi aktivitas antibakteri senyawa dalam fraksi aktif ekstrak etanol daun kersen (Muntingia calabura L) pada enzim dihydropteroate synthetase streptococcus pneumoniae secar in silico. S1 thesis, Universitas Ahmad Dahlan.

[thumbnail of JUDUL] Text (JUDUL)
T1_2000023136_JUDUL__240920030214.pdf
Download (2MB)
[thumbnail of BAB I] Text (BAB I)
T1_2000023136_BAB_I__240920030214.pdf
Download (1MB)
[thumbnail of BAB II] Text (BAB II)
T1_2000023136_BAB_II__240920030214.pdf
Restricted to Registered users only
Download (5MB) | Request a copy
[thumbnail of BAB III] Text (BAB III)
T1_2000023136_BAB_III__240920030214.pdf
Restricted to Registered users only
Download (1MB) | Request a copy
[thumbnail of BAB IV] Text (BAB IV)
T1_2000023136_BAB_IV__240920030214.pdf
Restricted to Registered users only
Download (3MB) | Request a copy
[thumbnail of BAB V] Text (BAB V)
T1_2000023136_BAB_V__240920030214.pdf
Restricted to Registered users only
Download (1MB) | Request a copy
[thumbnail of Daftar Pustaka] Text (Daftar Pustaka)
T1_2000023136_DAFTAR_PUSTAKA__240920030214.pdf
Restricted to Registered users only
Download (1MB) | Request a copy
[thumbnail of Lampiran] Text (Lampiran)
T1_2000023136_LAMPIRAN__240920030214.pdf
Restricted to Registered users only
Download (3MB) | Request a copy

Abstract

Pneumonia merupakan infeksi yang sering ditemukan pada usia lanjut, penyebab utama pneumonia yaitu karena infeksi bakteri streptococcus pneumoniae. Berbagai faktor dapat meningkatkan risiko usia lanjut mengalami pneumonia, diantaranya perubahan sistem imun, multipatologi, dan penurunan status fungsional. Penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa fraksi aktif antibakteri ekstrak daun kersen mengandung senyawa yaitu : 1,4-dihidroksi-2-metil antrakuinon; 1-Hidrroksi-2-metil antrakuinone; 3’,5-dihidroksi-7,4’-dimetoksi flavon; 3-Hidroksi-7-metoksi baicalein; neobavachalcone; digiprolactone; genistein; liquiritigenin; quercetagetin-3,4’-dimetil eter; sappanone B. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi aktivitas antibakteri terhadap enzim dihydropteroate synthetase Streptococcus pneumoniae secara in silico.
Dalam penelitian ini dilakukan molecular docking antara struktur tiga dimensi sepuluh senyawa dalam frasi aktif ekstrak daun kersen (Muntingia calabura L.) digunakan sebagai ligan, dan struktur kristal Dihydropteroate Synthetase (DHPS) Streptococcus pneumoniae digunakan sebagai reseptor yang sudah di preparasi sebelumnya dengan bantuan aplikasi PyMOL, AutoDock Tools 1.5.7 dan BIOVIA Discovery Studio 2024. Molekul atau senyawa kimia daun kersen diunduh melalui website pubchem. Prediksi toksisitas menggunakan Protox . Parameter molecular docking dianalisis berdasarkan nilai energi ikatan dan residu asam amino. Nilai afinitas dibandingkan dengan nilai afinitas ligan kristal dihydropteroate synthase dan senyawa pembanding sulfametoksazol dan sulfadiazine.
Hasil prediksi uji toksisitas senyawa uji menunjukkan bahwa semua senyawa uji memenuhi kriteria Protox. Validasi metode docking didapatkan nilai RMSD sebesar 0,475 Å yang berarti metode docking yang dipakai valid (RMSD ≤ 2 Å). Hasil molecular docking menunjukkan bahwa senyawa liquiritigenin mempunyai afinitas paling besar dibandingkan senyawa uji lainnya yaitu (-7,6 kcal/mol) dan lebih rendah dari senyawa pembandingnya sulfametoksazol sebesar (-6,3 kcal/mol) dan sulfadiazine (-5,7 kcal/mol).
Berdasarkan nilai energi ikatan dari molecular docking, senyawa Liquiritigenin diprediksi mempunyai potensi paling besar dalam menghambat protein Dihydropteroate synthetase bakteri Streptococcus pneumoniae dibandingkan senyawa uji lainnya.

Item Type: Thesis (S1)
Keyword: Pneumonia, streptococcus, pneumoniae, muntingia calabura, L, antibakteri, in silico, molecular docking
Subjects: R Medicine > R Medicine (General)
R Medicine > RS Pharmacy and materia medica
Divisi / Prodi: Faculty of Pharmacy (Fakultas Farmasi) > S1-Pharmacy (S1-Farmasi)
Depositing User: userperpus2 userperpus2
Date Deposited: 31 Oct 2024 06:41
Last Modified: 31 Oct 2024 06:41
URI: http://eprints.uad.ac.id/id/eprint/77283

Actions (login required)

View Item View Item